Лучше хранить навоз в бетонированной яме, но не менее эффективным может быть и более простой, доступный способ хранения — в кучах. При правильном хранении в кучах потери органического вещества и азота также можно свести к минимуму. Основой правильного хранения навоза является плотность его укладки. Выбирают тенистое место вдали от жилых строений.
Кладут навоз тонкими слоями (15-20 см), хорошо уплотняя каждый, пока высота кучи не достигнет 100-120 см. Если навоз очень сухой, его увлажняют и затем уплотняют. Летом при продолжительной засухе кучу периодически поливают водой.
Для уменьшения потерь азота, если есть возможность, к навозу хорошо добавить фосфорные удобрения и торф. Каждый слой навоза посыпают суперфосфатом из расчета 2% от веса навоза или фосфоритной мукой 3—5%. При использовании торфа слои навоза и торфа (15-20 см) чередуют, при этом самый нижний (первый) и самый верхний (последний) должны быть из торфа. При отсутствии торфа можно использовать обыкновенную землю из расчета 20-30% от веса навоза. Слой дерна с боков и сверху кучи предохранит ее от пересыхания.